16SrDNA测序后在ncbi上比对步骤

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/30 01:44:53
16SrDNA测序后在ncbi上比对步骤
关于DNA序列在NCBI上比对的问题

正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看

如何在NCBI中查基因密码子偏好性

NCBI没有这样的数据,你可以在CodonUsageDatabase查到相关物种的密码子偏好信息.CodonUsageDatabase数据库用以计算密码子偏好的序列数据都是来自NCBI,也是学术界和工

如何在ncbi上查找3‘UTR的序列

直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错

在NCBI上查找基因.

1、打开NCBI的主页2、在Search后面的第一个框内选择Nucledite3、在第二个框内输入你所要寻找的菌株名称4、点击Go5、在结果中过滤你需要的基因6、打开该搜索结果即可在最底部看到基因序列

如何在NCBI上查找某个基因的序列?

打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.

怎么在NCBI上比对其他基因?

你在NCBI主页上找一个BLAST.这是一个序列比对在线工具,自己摸索使用啦.基本的序列比对功能一定可以满足的.

如何在NCBI中查找某基因的外显子?急.

就查那个基因在下面有详细的描述包括哪哪是外显子再问:有没有什么详细的步骤啊,有点点看不懂那个网站。再答:NCBI首页搜然后点necleotide旁边那个数字然后找到那个基因然后下面各种描述exon后面

在NCBI中世系Lineage是什么意思?

Lineage里记录的信息是某个物种的分类地位,即它属于哪个门,哪个纲等等逐级说明.如:人的lineage:cellularorganisms;Eukaryota;Opisthokonta;Metaz

16srdna测序需要向测序公司提供序列外还要提供什么吗?

北京三博远志16srdna测序/鉴定说明:1、样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的DNA.2、如果样品为基因组DNA,DNA浓度>20ng/ul,体积大于20ul.3、鉴定结果一

如何在NCBI上得到猪的CDS序列

进行CDS分析,首先要有一段氨基酸序列(基因序列要转换成氨基酸序列),在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的SpecializedBLAST里的第三个链

如何在ncbi中下载gi和FASTA ?

找到序列后,ncbi上面靠左一些,屏幕的1/4处,有链接可以直接点.

细菌如何提取16srDNA(用来做种类鉴定的)

--16srDNA不是提取出来的~菌液提取基因组DNA,然后PCR扩增,引物用通用引物27F和1492R,扩增得到的1.5KB大小的产物就是16srDNA.然后你把PCR产物纯化一下送交测序公司测序,

利用16srDNA单向测序后的结果分析--求参考书籍,最好详细系统的讲述

这有啥好系统讲的,单端测序的数据比对一下就完了,还能咋样?

怎么在NCBI上搜索基因

1,如果你知道基因名称的话,进入NCBI主页,在选项后面选择GENE然后输入你要查找的基因名称.2,如果你知道基因序列的编号,选择NECLEOTID然后输入你的序列ID即可3如果你知道有关基因的部分信

怎样在NCBI中查找马的功能基因?

ncbi中也不是很多吧.那个里面的序列也都是人们提供进去的,有人研究过才有的,不是什么都能查到的百科全书.

如何在NCBI上注册一个基因

向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin.用那种办法,根据不同的需要.BankIt:(在线提交页面:http://www.ncbi.nlm.nih.g

转录因子序列在ncbi如何查找?

哪一个转录因子?不同的基因有不同的序列,转录因子也是某些基因表达的某类蛋白,只是这些蛋白能够结合到其他基因的转录调控区域(如启动子),从而调节其他基因的转录.作为某个特定的转录因子,必须明确它的名称(

16srDNA 测出的两条序列都要比对吗?详细最好了(整个鉴定流程)!我是新手

双向测序得到的两个序列如果有重叠区的话,那么可以做拼接.另外NCBI的blastn可以做两个序列的比较,通过blastn比较可以看两个序列有没有重叠序列.做拼接有专门的软件,如DNAstar里面的Se

如何在NCBI里得到序列

你这个是编号要在Nucleotide里找,你是选的在gene里找的吧.直接把序列连接给你:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AK065863再问:下面一大块的都是

如何在NCBI查基因名称

在前面的框里选gene,后面输入金黄色葡萄球菌的英文名和glucan,然后go,就可以了