蛋白质如果相似,那么什么相似?空间结构吗?

来源：学生作业帮编辑：搜狗做题网作业帮分类：生物作业时间：2024/05/07 19:46:41

首先,蛋白质相似是个很泛泛的概念.
如果是两个蛋白质similarity和identity如何如何,一般可以从以下几个方面考虑.
最根本的是,氨基酸序列相似,看氨基酸的保守性.一般序列比对程序都可以对序列比对进行打分,也就是给你identity的分值,分值越高,一级序列的相似性越好.
二,就是比对结构,PDB数据库收录了很多结构,一级序列相似不一定三级结构就一定相似,但是大多数来讲,如果一级的identity比较高,一般结构都有相似.
三,你可以通过进化上的关系来分析,同家族的蛋白质一般都有一些共性,比如一些带电性、相似的domains,或者一些活性位点.
目前就想到这些,希望对你有所帮助.

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