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我现在有了一个基因的cDNA序列,现在想找到这个基因的内含子序列,怎么办?

来源:学生作业帮 编辑:搜狗做题网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/04/28 08:18:37
我现在有了一个基因的cDNA序列,现在想找到这个基因的内含子序列,怎么办?
听说有一种方法是找相近物种该基因的全序列,然后做比对然后找到内含子位置,再设计引物将内含子区域测序?有没有用过这种方法的?能不能说一下具体怎么操作?选什么物种?用什么软件比较序列?
我现在有了一个基因的cDNA序列,现在想找到这个基因的内含子序列,怎么办?
为具有与某RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA即complementary DNA之缩写,或此DNA链与具有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链.与RNA链互补的单链DNA,以其RNA为模板,在适当引物的存在下,由依赖RNA的DNA聚合酶(反转录酶)的作用而合成,并且在合成单链cDNA后,在用碱处理除去与其对应的RNA以后,以单链cDNA为模板,由依赖DNA的DNA聚合酶或依赖RNA的DNA聚合酶的作用合成双链cDNA.真核生物的信使RNA或其他RNA的cDNA,在遗传工程方面广为应用.在这种情况下,mRNA的cDNA,与原来基因的DNA(基因组DNA,genomic DNA)不同而无内含子;相反地对应于在原来基因中没有的而在mRNA存在的3′末端的多A序列等的核苷序列上,与exon序列、先导序列以及后续序列等一起反映出mRNA结构.cDNA同样可以被克隆.